Você pode criar uma regra de cupom que seja válida somente para grupos específicos de clientes, mas antes de fazer isto é necessário criar os grupos e logo depois criar o cupom de desconto.

Na página de criação de cupom, no campo de Grupo de Clientes, selecione os grupos dos quais serão direcionados o cupom

Logo depois de tudo preenchido corretamente, clique em 

Vale lembrar que o cupom só será válido caso o cliente esteja comprando logado em sua conta, e também é preciso que o mesmo esteja em algum grupo, o passo a passo pode ser visto aqui.